Arqueomallornauta es un proyecto conjunto del Consejo de Mallorca y las Universidades de las Illes Balears, de Barcelona y de Cádiz, que tiene como objetivo el desarrollo de varias acciones estratégicas para analizar el tráfico marítimo en Mallorca durante la Antigüedad tardía a través de los restos subacuáticos, entre los cuales el pecio de Ses Fontanelles. El proyecto tiene el apoyo de Puertos de Baleares, el Ayuntamiento de Palma, el Club Marítimo San Antonio de la Playa, el Obispado de Mallorca, la Armada, la Guardia Civil, y la Brigada de Patrimonio Histórico del Consell de Mallorca.
El proyecto Arqueomallornauta tiene que permitir recuperar todo el material localizado en el pecio de Ses Fontanelles, incluso posiblemente el barco, estudiarlo y hacer un plan de difusión en el que se prevé la musealización para ser expuesto en el Museo de Mallorca.
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